草履蟲是動物界原生生物門、纖毛門、肉足綱、草履蟲目(Cyclopoda)的一種單細胞生物。它屬于節肢動物門的甲殼類，身體呈長圓筒形，前端有口，后端有一尾，體表覆蓋著幾丁質的硬殼，頭部和尾部各有一個眼點，無頭腺;身體分為前部(頭)、中部和尾部。

草履蟲的身體由頭部、軀干和后端3部分組成。頭部包括口器，其上有唇，可分泌粘液。軀干包括前后兩片背葉，每片背葉上具有一對側枝，其中央為肛門，兩側各有1個生殖孔。末端為尾，分叉，末端具肛環。

在形態結構方面，草履蟲與昆蟲相似，但比昆蟲簡單，只有一條縱行的肌肉，沒有神經系統和大腦。從外部觀察，它的身體是由一個中央大核和周圍的小核構成。每個小核又由兩個亞核組成，它們之間通過細絲相連，這種細絲叫微管，微管之間有電子傳遞鏈。

這些小核和小亞基構成了細胞的質膜，質膜外面還有一層被覆物——外膜。此外，還存在著許多非細胞結構的物質，如內質網，高爾基體，溶酶體，線粒體等。由于這些物質的參與，使整個細胞呈現出一定的功能。

例如，當外界的水進入體內時，首先通過微管將外界的營養物運送到各個組織，然后，再經過內質網分解代謝，變成能量供全身利用。因此，可以說，整個細胞是一個巨大的"化學生態系統"。

另外，由于體內的水分不斷減少，所以，為了維持生命活動，必須不斷地進行呼吸作用，以吸收空氣中的氧氣，排出體內的二氧化碳。而這一過程則是由位于咽部的鰓弓完成的。草履蟲的結構圖如上。

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