科學家測出楊樹基因組草圖
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2023-04-09
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科學家首次測序了一種名為黑三角葉楊的樹的基因組，使他們能夠開始尋找哪些遺傳密碼形成了長活的、木質植物，而不是像擬南芥那樣的開花植物。樹在一個地點生活幾十年甚至上百年，周圍的環境不斷地變化，它們一定有非凡的生存戰略。Gerald Tuskan 和他的合作者指出，樹覆蓋了地球陸地表面的30%，它們必須制造木制材料，在長距離上協調信號和營養，經歷季節變化和其它氣候周期而存活。樹的基因組將為它們如何完成這些高招提供線索。Tuskan和他的國際小組用了散彈法和序列組裝，將基因組分成片段，測序這些片斷，然后靠比較端部的序列將它們組裝起來。他們將這個方法與遺傳圖譜結合起來，遺傳圖譜是指標明了遺傳標記位置的大致基因組，組裝出Populus trichocarpa 的基因組草圖。結果顯示，該樹經歷了兩個整個基因組復制事件，其中一個發生的時間與擬南芥中發生的同時。文章作者報告說，這個楊樹的基因組看起來必擬南芥的基因組進化得慢。與擬南芥相比，楊樹有抵抗疾病、分生組織（根和幼芽）發育、代謝輸運、以及合成植物細胞壁的纖維素和木質素的擴展的基因庫。
Populus trichocarpa
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